Ο Χρήστος Τριανταφυλλίδης εργάστηκε από το 2001 ως το 2004 στο Υπολογιστικό Κέντρο του Τμήματος Φυσικής του Α.Π.Θ. Από το 2004 ως σήμερα εργάζεται στο Εργαστήριο Πλεγματικών Υποδομών του Α.Π.Θ ως εξωτερικός συνεργάτης σε ερευνητικά έργα ,όπως το EGEE, το SEE-GRID, το EUChinaGrid και το HellasGrid. Η κύρια ενασχόληση του είναι στον ευρύτερο τομέα της ασφάλειας ηλεκτρονικών υπόδομών με ιδιαίτερη έμφαση στον έλεγχο πολιτικών ασφαλείας και την διαχείρηση της εθνικής Αρχής Πιστοποίησης HellasGrid CA. Παράλληλα έχει ασχοληθεί με την διαχειρισή κατανεμημένων υπολογιστικών συστημάτων, με έμφαση τον σχεδιασμό εργαλείών μαζικής διαχείρισης υπολογιστών. Από το 2006 εκπροσωπεί την Αρχή Πιστοποίησης HellasGrid στο ευρωπαϊκό σώμα EUGridPMA.